Wskazania do stosowania ultradźwięków stanowią: zespoły bólowe przy chorobach zwyrodnieniowych stawów kręgosłupa, bóle krzyża i pleców, rwa kulszowa, choroby zwyrodnieniowe stawów biodrowych, kolanowych oraz stawów rąk i nóg, zespół bolesnego barku, zespół bolesnego łokcia, ostroga kości piętowej, nerwoból nerwu trójdzielnego, bóle poamputacyjne, szczękościsk, owrzodzenie goleni oraz blizny.
Natomiast przeciwwskazania do stosowania zabiegu ultradźwięków obejmują: nowotwory oraz stany po ich usunięciu, ciąże, gruźlica, skazy krwotoczne, niewydolność krążenia, zaburzenia rytmu serca, obecność rozrusznika serca, zaburzenia ukrwienia obwodowego, zakrzepowe zapalenie żył, ostre procesy zapale oraz stany gorączkowe, ciężki stan ogólny, wyniszczenie organizmu, nie zakończony wzrost kości, stany po terapii promieniami rentgenowskimi, obecność w tkankach metalowych ciał obcych, nerwica wegetatywna znacznego stopnia, nerwobóle niewyjaśnionego pochodzenia.
Nie wykonuje się zabiegu ultradźwięków na okolicę kręgosłupa szyjnego powyżej trzeciego kręgu, działanie energii może uszkodzić rdzeń przedłużony. Należy unikać nadźwiękawiania okolic narządów wewnętrznych i jamy brzusznej a także okolic serca. Osoby z zaawansowaną cukrzycą oraz powierzchniowymi zaburzeniami czucia wymagają stosowania jak najmniejszych dawek ultradźwiękowych. Szczególną ostrożność zachować należy przy wykonywaniu zabiegu na okolice twarzy, mając na uwadze możliwość działania fali na mózg i oczy.