U kobiet objawy rzęsistkowicy to przede wszystkim obfite upławy, które są pieniste i cuchnące oraz mają barwię żółtą lub zielonkawą. Dodatkowo obserwuje się podrażnienie, zaczerwienienie i świąd sromu oraz pochwy, a także ból przy częstym oddawaniu moczu (parcie na pęcherz), nieprzyjemny zapach, ból w okolicy nadłonowej oraz bolesne stosunki płciowe.
U mężczyzn głównymi objawami są: świąd i ból cewki moczowej, obfity i ropny wyciek z cewki, częste oddawanie moczu połączone z pieczeniem, obrzęk, zaczerwienienie i nadżerki na żołędzi i napletku. Również u mężczyzn choroba może przebiegać bezobjawowo.
Nieleczona rzęsistkowica może powodować problemy z oddawaniem moczu oraz niepłodność.
Monika K